SARS-CoV-2(武漢肺炎ウイルス)が持つ蛋白の一つ。S蛋白のSは「スパイク」を意味し「スパイク蛋白」と呼ばれることも多い。抗原として考えると「S抗原」とも呼ばれる
SARS-CoV-2(武漢肺炎ウイルス)がもつゲノム(オリジナルのものは29,903塩基対)のうち、終止コドンを含む21563..25384の範囲(遺伝子長3822、アミノ酸長1274)から作られる蛋白質である。
これは、SARS-CoV-2を包む皮のように存在する脂質二重膜(エンベロープ)の表面にある蛋白質の一つで、これが他の生物細胞にくっついて感染を手助けする。従って、生物の免疫系がこのS蛋白を攻撃できればウイルスは感染が困難になる。対し、ウイルス粒子内部に存在するもので良く知られるのはN蛋白である。
SARS-CoV-2用のワクチンはこのS蛋白の遺伝子を用いて作られており、これを接種するとワクチンの種類により直接または間接的に抗原として体内にS蛋白を侵入させ「S抗原」として働かせ、結果免疫によってS蛋白(S抗原)を標的とする抗S抗体が作られる働きが得られる。
これにより万一体内にSARS-CoV-2が侵入したとしても感染しにくくなり、万一感染してしまっても免疫はウイルスのS蛋白への攻撃を続けるのでウイルスの増殖が困難となり重症化を抑えることができる。
SARS-CoV-2では、N蛋白(N抗原)およびこれにより誘導される抗N抗体が非常に有毒有害であることから、ワクチンで誘導される抗S抗体よりも感染で誘導される抗N抗体の方がリスクが高いと考えられる。
終止コドンを含む21563..25384の範囲(遺伝子長3822、アミノ酸長1274)から作られる、遺伝子Sのアミノ酸配列は次の通りである。これは支那の武漢市で検出されたオリジナルのSARS-CoV-2(いわゆる武漢株、Wuhan-Hu-1)のもので、他の株は概ねどこかが変異している。末端の終止コドンは略し、実際の1,273アミノ酸長を記す。
ORIGIN 1 MFVFLVLLPL VSSQCVNLTT RTQLPPAYTN SFTRGVYYPD KVFRSSVLHS TQDLFLPFFS 61 NVTWFHAIHV SGTNGTKRFD NPVLPFNDGV YFASTEKSNI IRGWIFGTTL DSKTQSLLIV 121 NNATNVVIKV CEFQFCNDPF LGVYYHKNNK SWMESEFRVY SSANNCTFEY VSQPFLMDLE 181 GKQGNFKNLR EFVFKNIDGY FKIYSKHTPI NLVRDLPQGF SALEPLVDLP IGINITRFQT 241 LLALHRSYLT PGDSSSGWTA GAAAYYVGYL QPRTFLLKYN ENGTITDAVD CALDPLSETK 301 CTLKSFTVEK GIYQTSNFRV QPTESIVRFP NITNLCPFGE VFNATRFASV YAWNRKRISN 361 CVADYSVLYN SASFSTFKCY GVSPTKLNDL CFTNVYADSF VIRGDEVRQI APGQTGKIAD 421 YNYKLPDDFT GCVIAWNSNN LDSKVGGNYN YLYRLFRKSN LKPFERDIST EIYQAGSTPC 481 NGVEGFNCYF PLQSYGFQPT NGVGYQPYRV VVLSFELLHA PATVCGPKKS TNLVKNKCVN 541 FNFNGLTGTG VLTESNKKFL PFQQFGRDIA DTTDAVRDPQ TLEILDITPC SFGGVSVITP 601 GTNTSNQVAV LYQDVNCTEV PVAIHADQLT PTWRVYSTGS NVFQTRAGCL IGAEHVNNSY 661 ECDIPIGAGI CASYQTQTNS PRRARSVASQ SIIAYTMSLG AENSVAYSNN SIAIPTNFTI 721 SVTTEILPVS MTKTSVDCTM YICGDSTECS NLLLQYGSFC TQLNRALTGI AVEQDKNTQE 781 VFAQVKQIYK TPPIKDFGGF NFSQILPDPS KPSKRSFIED LLFNKVTLAD AGFIKQYGDC 841 LGDIAARDLI CAQKFNGLTV LPPLLTDEMI AQYTSALLAG TITSGWTFGA GAALQIPFAM 901 QMAYRFNGIG VTQNVLYENQ KLIANQFNSA IGKIQDSLSS TASALGKLQD VVNQNAQALN 961 TLVKQLSSNF GAISSVLNDI LSRLDKVEAE VQIDRLITGR LQSLQTYVTQ QLIRAAEIRA 1021 SANLAATKMS ECVLGQSKRV DFCGKGYHLM SFPQSAPHGV VFLHVTYVPA QEKNFTTAPA 1081 ICHDGKAHFP REGVFVSNGT HWFVTQRNFY EPQIITTDNT FVSGNCDVVI GIVNNTVYDP 1141 LQPELDSFKE ELDKYFKNHT SPDVDLGDIS GINASVVNIQ KEIDRLNEVA KNLNESLIDL 1201 QELGKYEQYI KWPWYIWLGF IAGLIAIVMV TIMLCCMTSC CSCLKGCCSC GSCCKFDEDD 1261 SEPVLKGVKL HYT
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SARS-CoV-2
